Непосредственное управление деятельностью Центра детского творчества осуществляет директор, который представляет интересы учреждения, распоряжается в установленном порядке имуществом, заключает договоры, выдает доверенности, пользуется правом распоряжения средствами, утверждает штаты, издает  приказы обязательные для всех работников учреждения, исполняет другие обязанности согласно должностной инструкции.

Директор формирует администрацию учреждения и коллектив сотрудников, административный вспомогательный и обслуживающий персонал.

Управление МОУ Центром осуществляется на принципах коллегиальности, в соответствии с законодательством РФ, Уставом, носит демократический характер. Педагогические работники, обучающиеся и родители (законные представители) имеют право на участие в управлении. Формы самоуправления, порядок выбора органов самоуправления, их компетенция определяется Уставом МОУ Центра.

Формами самоуправления Центра являются: Совет Центра, Попечительский совет, общее собрание трудового коллектива, Педагогический совет.

Общее руководство Центром осуществляет выборный представительный орган – Совет Центра, который состоит из представителей трудового коллектива, обучающихся, родителей, представителей общественности. Кандидатуры в члены Совета Центра выдвигаются на соответствующих собраниях коллективов, регламентируется Уставом и Положением о Совете Центра, утвержденным общим собранием трудового коллектива Центра.